李梓榕^1* , 袁雄^1* , 陈叶¹ , 郑兴飞 ² , 胡中立² , 李兰芝^1,3

1 湖南农业大学, 农业大数据分析与决策工程技术研究中心, 长沙, 410128; 2 武汉大学, 杂交水稻国家重点实验室, 武汉, 430072; 3 湖南杂交水稻研究中心, 杂交水稻国家重点实验室, 长沙, 410125
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 22 篇   
收稿日期: 2019年06月24日    接受日期: 2019年06月28日    发表日期: 2020年09月11日

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加强水稻种质资源的管理及保护，针对 SNP 鉴定费用昂贵的缺陷，本研究发展了一种快速筛选单核苷酸多态性(SNP)标记构建 DNA 指纹图谱的方法。本研究首先采用“分而治之”和“贪婪”的组合策略从全基因组 SNP 标记中筛选出可鉴定全部参试材料的 SNP 组合，再通过程序循环精简其中的 SNP 标记，用少量的 SNP 标记构建指纹图谱。利用该方法对 117 个水稻种质 SNP 标记进行筛选，最少用 12 个 SNP 标记可完全鉴定该套种质。为提高种质鉴定的容错能力，进一步采用由 39 个核心 SNP 标记组成的 SNP 并集组合构建指纹图谱。本研究为精简 SNP 构建指纹图谱提供了新的有效途径，构建的种质指纹图谱结果亦可为水稻种质资源鉴定提供一定参考。 

水稻；单核苷酸多态性；DNA 指纹图谱； 品种身份证